Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN1Q14699 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN1Q14699 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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