Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GBX1Q14549 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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GBX1Q14549 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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GBX1Q14549 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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GBX1Q14549 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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GBX1Q14549 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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GBX1Q14549 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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GBX1Q14549 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GBX1Q14549 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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