Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM29Q14134 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM29Q14134 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms