Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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COL4A6Q14031 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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COL4A6Q14031 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL4A6Q14031 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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