Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX2Q13950 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX2Q13950 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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