Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1CQ13936 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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