Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
PKP1Q13835 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PKP1Q13835 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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