Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms