Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C1orf61Q13536 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms