Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BFSP2Q13515 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
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