Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDAP1Q13442 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms