Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATMQ13315 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATMQ13315 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATMQ13315 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ATMQ13315 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATMQ13315 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATMQ13315 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATMQ13315 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATMQ13315 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATMQ13315 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATMQ13315 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATMQ13315 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATMQ13315 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATMQ13315 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATMQ13315 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATMQ13315 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATMQ13315 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATMQ13315 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATMQ13315 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATMQ13315 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATMQ13315 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATMQ13315 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATMQ13315 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATMQ13315 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATMQ13315 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATMQ13315 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATMQ13315 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATMQ13315 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATMQ13315 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATMQ13315 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATMQ13315 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATMQ13315 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATMQ13315 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATMQ13315 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATMQ13315 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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