Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL28Q13084 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL28Q13084 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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