Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK2Q13002 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK2Q13002 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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