Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPRL3Q12980 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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