Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBRQ0VD83 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms