Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms