Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSPL2Q05D32 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms