Protein–RNA interactions for Protein: Q05823

RNASEL, 2-5A-dependent ribonuclease, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASELQ05823 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RNASELQ05823 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms