Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN12Q05209 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms