Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EMX2Q04743 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms