Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP7AQ04656 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms