Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PLOD1Q02809 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms