Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFRSF17Q02223 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms