Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PRCDQ00LT1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PRCDQ00LT1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms