Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IRF9Q00978 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms