Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKL1Q00532 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKL1Q00532 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms