Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VLDLRP98155 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VLDLRP98155 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms