Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VBP1P61758 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VBP1P61758 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VBP1P61758 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms