Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms