Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP107P57740 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP107P57740 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP107P57740 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP107P57740 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP107P57740 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP107P57740 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP107P57740 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP107P57740 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP107P57740 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP107P57740 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP107P57740 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP107P57740 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP107P57740 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP107P57740 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP107P57740 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP107P57740 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms