Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK1P57059 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIK1P57059 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIK1P57059 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIK1P57059 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIK1P57059 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SIK1P57059 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIK1P57059 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIK1P57059 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIK1P57059 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIK1P57059 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIK1P57059 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIK1P57059 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIK1P57059 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIK1P57059 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIK1P57059 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIK1P57059 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIK1P57059 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIK1P57059 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIK1P57059 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIK1P57059 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIK1P57059 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIK1P57059 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIK1P57059 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIK1P57059 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIK1P57059 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIK1P57059 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIK1P57059 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK1P57059 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK1P57059 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK1P57059 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK1P57059 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK1P57059 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK1P57059 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK1P57059 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK1P57059 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK1P57059 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK1P57059 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK1P57059 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK1P57059 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK1P57059 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK1P57059 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK1P57059 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK1P57059 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIK1P57059 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK1P57059 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK1P57059 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK1P57059 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK1P57059 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK1P57059 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK1P57059 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK1P57059 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK1P57059 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK1P57059 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK1P57059 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK1P57059 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK1P57059 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK1P57059 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK1P57059 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK1P57059 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK1P57059 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK1P57059 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK1P57059 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK1P57059 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK1P57059 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIK1P57059 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms