Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP9P55211 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP9P55211 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP9P55211 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP9P55211 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP9P55211 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP9P55211 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP9P55211 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP9P55211 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP9P55211 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP9P55211 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP9P55211 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms