Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRPF1P55201 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms