Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPAP53621 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPAP53621 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COPAP53621 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPAP53621 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms