Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLK1P49759 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLK1P49759 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLK1P49759 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLK1P49759 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLK1P49759 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLK1P49759 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLK1P49759 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLK1P49759 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLK1P49759 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLK1P49759 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLK1P49759 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLK1P49759 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLK1P49759 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLK1P49759 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLK1P49759 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLK1P49759 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLK1P49759 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLK1P49759 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLK1P49759 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLK1P49759 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLK1P49759 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLK1P49759 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLK1P49759 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLK1P49759 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLK1P49759 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLK1P49759 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLK1P49759 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLK1P49759 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms