Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM1P49642 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms