Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMPHP49418 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AMPHP49418 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMPHP49418 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMPHP49418 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AMPHP49418 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMPHP49418 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMPHP49418 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMPHP49418 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMPHP49418 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AMPHP49418 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMPHP49418 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMPHP49418 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPHP49418 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPHP49418 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
AMPHP49418 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
AMPHP49418 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMPHP49418 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMPHP49418 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMPHP49418 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMPHP49418 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMPHP49418 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMPHP49418 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMPHP49418 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMPHP49418 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMPHP49418 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AMPHP49418 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMPHP49418 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMPHP49418 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMPHP49418 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMPHP49418 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMPHP49418 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMPHP49418 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMPHP49418 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms