Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GRIA4P48058 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIA4P48058 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms