Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTRNP46939 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTRNP46939 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTRNP46939 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTRNP46939 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTRNP46939 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTRNP46939 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UTRNP46939 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UTRNP46939 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UTRNP46939 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UTRNP46939 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UTRNP46939 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UTRNP46939 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UTRNP46939 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UTRNP46939 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UTRNP46939 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UTRNP46939 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UTRNP46939 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UTRNP46939 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UTRNP46939 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UTRNP46939 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UTRNP46939 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UTRNP46939 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UTRNP46939 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
UTRNP46939 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTRNP46939 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTRNP46939 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTRNP46939 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTRNP46939 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTRNP46939 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTRNP46939 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTRNP46939 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTRNP46939 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTRNP46939 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTRNP46939 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UTRNP46939 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UTRNP46939 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTRNP46939 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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