Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CRATP43155 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CRATP43155 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRATP43155 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRATP43155 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms