Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA2P42262 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms