Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPAP38571 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LIPAP38571 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LIPAP38571 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LIPAP38571 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LIPAP38571 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms