Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGAEP38570 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGAEP38570 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms