Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJC1P36383 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJC1P36383 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJC1P36383 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJC1P36383 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJC1P36383 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GJC1P36383 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJC1P36383 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJC1P36383 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJC1P36383 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GJC1P36383 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GJC1P36383 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJC1P36383 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJC1P36383 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJC1P36383 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms