Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTX2P32243 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OTX2P32243 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTX2P32243 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms