Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCKBRP32239 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms