Protein–RNA interactions for Protein: P31249

HOXD3, Homeobox protein Hox-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3P31249 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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HOXD3P31249 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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HOXD3P31249 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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HOXD3P31249 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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HOXD3P31249 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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