Protein–RNA interactions for Protein: P29016

CD1B, T-cell surface glycoprotein CD1b, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1BP29016 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD1BP29016 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD1BP29016 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD1BP29016 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD1BP29016 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD1BP29016 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD1BP29016 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD1BP29016 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD1BP29016 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD1BP29016 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD1BP29016 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD1BP29016 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD1BP29016 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD1BP29016 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD1BP29016 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD1BP29016 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD1BP29016 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD1BP29016 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD1BP29016 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD1BP29016 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD1BP29016 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD1BP29016 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD1BP29016 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD1BP29016 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms