Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRMP28827 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRMP28827 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
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